经济动物学报

2020, v.24(02) 71-77

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鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体COI基因序列比较
Sequence Comparison of Mitochondrial COI Gene in the Fishes of Blennioidei

陈博锦;王伟;孙鹏飞;牟玉双;王月;魏艳超;

摘要(Abstract):

应用生物信息学方法对12种鳚亚目鱼类线粒体COI基因序列片段进行了比较分析。结果表明:COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量(54.40%)明显高于G+C含量(45.60%)。转换和颠换位点数分别为59和42个。应用Kimura双参数法计算鳚亚目鱼类COI基因序列的种间遗传距离,结果表明:种间平均遗传距离为0.232 4,是种内遗传距离的9.62倍。应用MP和NJ法构建了分子系统发生树,结果显示,方氏云鳚、云鳚和六线鳚聚在一起,然后与颈鳍脂鳚聚在一起,再与巴西拟隆胎鳚、巴哈马拟隆胎鳚聚类,最后与疣眼吉氏指鰧聚类;粗头岩游鳚、环项副鳚和横带斯氏脂胎鳚聚为另一分支;背叉触角鳚并没有聚成一个单系分支,而是与旗鳚科和三鳍鳚科的鱼类交叉。此外,分子系统发生树的构建结果大部分与形态学分类结果相一致,相比之下,NJ法较MP法构建的分子系统发生树与鳚亚目鱼类形态学分类结果更接近。

关键词(KeyWords): 鳚亚目鱼类;COI;基因序列;分子系统发生树

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 大连市科技基金创新项目(2019J12SN64);; 辽宁省科学技术计划项目(2018203004)

作者(Author): 陈博锦;王伟;孙鹏飞;牟玉双;王月;魏艳超;

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DOI: 10.13326/j.jea.2019.1413

参考文献(References):

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