经济动物学报

2021, v.25(01) 33-41+50

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利用混合模板筛选多态性微卫星的北极狐群体遗传学分析
Genetic Analysis of Arctic Fox Population Using Mixed Template to Test Polymorphic Microsatellites

刘丽;王东权;徐艳春;杨淑慧;

摘要(Abstract):

在群体遗传学研究中,微卫星是重要的分子标记之一,由于其在近缘物种间具有一定的通用性,因此常被跨物种使用,但测试其多态性的过程非常繁琐。本研究采用混合模板扩增的方法,快速简便地评估微卫星位点的多态性,为开展群体遗传学分析获得有用的微卫星标记,以10只北极狐(Alopex lagopus)的DNA为材料,分别随机抽取2,3,5,8个和全部10个样品进行等量混合作为模板,用10个微卫星位点的引物进行扩增,以全自动测序仪进行电泳分型。结果表明:所有等位基因的电泳信号峰都清晰可辨。与单一模板扩增相比,混合模板扩增时,所有位点的复等位基因都能稳定地显示出来,不同批次试验之间的重现性达到100%。信号峰面积与等位基因频率呈线性正相关,可用以推断待测位点的基因频率分布情况。最高信号峰与最低信号峰的面积之比与混合样品数呈正相关,与多态信息含量呈负相关,提示混合样品的数量存在一定限度,到一定限度时低频等位基因无法检出。同时,通过这一关系,也可以推测位点的多态信息含量。本研究从10个位点中获得5个具有多态性的位点,3个可用于北极狐遗传分析。

关键词(KeyWords): 微卫星;北极狐;毛细管电泳;多态性

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家重点研发计划项目(2018YFD0502201)

作者(Author): 刘丽;王东权;徐艳春;杨淑慧;

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DOI: 10.13326/j.jea.2020.1472

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