梅花鹿Myf5基因的cDNA克隆及表达分析cDNA Cloning and Expression Analysis of Myf5 Gene in Sika Deer
赵欢乐;夏彦玲;韩若冰;张芙蕊;李和平;刘伟石;
摘要(Abstract):
为获得梅花鹿生肌调节因子(Myf5)基因编码区序列(CDS),并探讨该基因在雌雄梅花鹿及其不同部位的肌组织间差异表达情况,以成年健康雌雄梅花鹿心肌、背最长肌、股四头肌、臀大肌、肋间肌组织为试验材料,以臀大肌组织cDNA为模板克隆获得Myf5基因CDS,运用生物信息学软件进行测序及分析,并利用实时荧光定量PCR技术检测Myf5基因在不同部位的肌组织间相对表达量。结果表明:克隆得到的梅花鹿Myf5基因CDS全长为768 bp;与GenBank上公布的家牛(Gene ID:281335)Myf5基因CDS的同源性为99.61%;梅花鹿与家牛的遗传距离最近,聚为同一支;梅花鹿Myf5蛋白氨基酸组成中丝氨酸含量最高,占氨基酸总量的13.3%;Myf5蛋白具有较强的亲水性,其蛋白二级结构包含α-螺旋、延伸链、无规则卷曲和β-折叠;荧光定量结果分析表明,梅花鹿Myf5基因在雌、雄梅花鹿及其不同部位的肌组织间均有差异性表达。
关键词(KeyWords): 梅花鹿;Myf5基因;克隆;生物信息学分析;表达差异
基金项目(Foundation): 国家级林业科技推广项目([2019]08号)
作者(Authors): 赵欢乐;夏彦玲;韩若冰;张芙蕊;李和平;刘伟石;
DOI: 10.13326/j.jea.2022.1683
参考文献(References):
- [1] 张静,郭月英,任霆,等.生肌调节因子及其对肉质的影响[J].食品与发酵工业,2014,40(5):183-187.
- [2] Mcilwraith C W.Frank milne lecture:From arthroscopy to gene therapy:30 years of looking in joints[J].Am Assoc Equine Pract,2005,51:65-113.
- [3] 高玲,谷大海,徐志强,等.MRFs基因家族对肉品质影响的研究进展[J].黑龙江畜牧兽医,2015 (9):65-67.
- [4] 王欢玲,白俊艳,王旭,等.家畜MRFs基因家族的研究进展[J].畜禽业,2015 (5):60-63.
- [5] 李秋玲.梅花鹿肉营养价值及肉质评价方法研究进展[J].经济动物学报,2005,9(1):54-56.
- [6] 苏丹.老龄梅花鹿肉嫩化方法研究[D].长春:吉林大学,2012.
- [7] 徐舶,周光宏,徐幸莲,等.不同部位鹿肉在宰后成熟过程中超微结构的变化[J].南京农业大学学报,2008,31(1):107-111.
- [8] Huff-Lonergan E,Parrish F C,Robson R M .Effects of post mortem aging time,animal age and sex on degradation of titin and nebulin in bovine long issim us muscle[J].Journal of Animal Science,1995,73:1064-1073.
- [9] 朱秋劲,李洪军,贺承渊,等.腌制对鹿肉理化性质影响的研究[J].吉林农业大学学报,2001,23(3):121-124.
- [10] 周亚军,王淑杰,闫琳娜,等.重组鹿肉制品的加工特性[J].农业工程学报,2008,24(9):268-275.
- [11] 朱麒,谭家明,夏琴,等.陆川猪Myf5基因克隆及其在背最长肌中发育性变化表达研究[J].黑龙江畜牧兽医,2019 (11):6-10,16.
- [12] Simms D,Cizdziel P E,Chomczynski P.TRIzol TM:A new reagent for optimal single-step isolation of RNA[J].Focus,1993,15(4):532-535.
- [13] 王强辉,翟健程,夏彦玲,等.驯鹿EGFR基因克隆及序列分析[J].东北林业大学学报,2017,45(9):77-80.
- [14] 杨明娟,陈宏.牛MRFs基因家族研究进展[J].中国牛业科学,2010,36(6):51-55.
- [15] So bolewska A,Elminowska-Wenda G,Bogucka J,et al.Myogenesis possibilities of its stimulation in chickens[J].Folia Biologica,2011,59(3/4):3-4.
- [16] Schwarz J J,Chakraborty T,Martin J,et al.The basic region of myogenin cooperates with two transcription activa-tion domains to induce muscle-specific transcription[J].Molecular and Cellular Biology,1992,12(1):266-275.
- [17] 王琼,刘益平,蒋小松,等.Myo G基因多态性与优质肉鸡屠宰性状和肉质性状的相关性分析[J].遗传,2007 (9):59-66.
- [18] 储明星,何远清,王金玉,等.绵羊肌细胞生成素基因外显子1的PCR-SSCP分析[J].农业生物技术学报,2005 (1):77-80.
- [19] 邓凤,田春英,刘国平.羊肌细胞生成素基因内含子的克隆及序列分析[J].畜牧与饲料科学,2006 (3):20-24.
- [20] Dagmara R H,Jolanta O,Beata Z,et al.Effect of the g.-723G→T polymorphism in the bovine Myogenic factor 5(Myf5)gene promoter region on gene transcript level in the longissimus dorsi muscle and on meat traits of polish Holstein-Friesian cattle[J].Biochem Genet,2010,48:450-464.
- [21] 韦宏伟,徐刚毅,汪代华,等.Myf5基因多态性与山羊生长性状相关分析[J].中国畜牧杂志,2011,47(7):15-17.
- [22] 孙文浩.鸡Myf5和Myf6基因的SNP多态性及其与屠宰性状和肉质性状的相关性分析[D].雅安:四川农业大学,2008.
- [23] 陶志云,邹剑敏,宋迟,等.鸭胚骨骼肌生肌调节因子Myo D1和Myf5发育性变化研究[J].中国家禽,2012,34(17):16-19.
- [24] 朱春红,宋迟,陶志云,等.鸭胚骨骼肌不同组织Myf6基因表达的发育性变化研究[J].中国畜牧兽医,2013,40(2):138-142.
- [25] 钟茂春,郑光明,赵建,等.鲮 Myf5基因克隆及其SNPs分析[J].中国水产科学,2010,17(4):681-687.
- [26] Weinberg E S,Allende M L.Developmental regulation of zebrafish MyoD in wild-type,no tail and spadetail embryos[J].Development,1996,122(1):271-280.
- [27] 严婷婷,邵芳,王野,等.赤眼鳟Myf5基因的克隆、序列和表达分析[J].常熟理工学院学报,2011,25(8):71-74.
- [28] 曹辉龙.南江黄羊 MRFs基因家族的分离克隆及其在肌肉组织中的表达规律研究[D].雅安:四川农业大学,2011.